ß-lactamasas de espectro extendido y factores de virulencia en Escherichia coli uropatógenas en asilos de ancianos en Lima, Perú / ß-lactamases and virulence factors in uropathogenic Escherichia coli in nursing homes in Lima, Peru

RESUMEN Los asilos de ancianos son instituciones con una alta prevalencia de infecciones del tracto urinario ocasionado por Escherichia coli productoras de ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE), con diversos factores de virulencia. El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia del gen bla CTX-M y de ocho genes de virulencia en 35 E. coli uropatógenas productoras de BLEE provenientes de seis asilos en Perú, durante el 2018. El 57,1% (20/35) de las E. coli fueron portadores del gen bla CTX-M. Además, se obtuvo una frecuencia del 46% (15/35) y 37% (13/35) de hly-alfa y cnf-1, respectivamente; elevada presencia de los genes iucC (63%, 22/35), aer (94%, 33/35) y chuA (94%, 33/34) y una frecuencia del 46% (16/35) y del 91% (32/34) de los genes pap GII y nanA, respectivamente. Existe predominancia en la distribución del gen bla CTX-M, además de una alta frecuencia de exotoxinas que le confieren una ventaja competitiva para diseminarse hacia el torrente sanguíneo.

ABSTRACT Nursing homes are institutions with high prevalence of urinary tract infections caused by ESBL-producing E. coli with several virulence factors. The aim of this study was to determine the frequency of the bla CTX-M gene and eight virulence genes in 35 ESBL-producing uropathogenic E. coli from six nursing homes in Peru during 2018. Of the E. coli samples, 57.1% (20/35) were carriers of the bla CTX-M gene. Furthermore, we obtained frequencies of 46% (15/35) and 37% (13/35) for hly-alpha and cnf-1, respectively; we also found high presence of the iucC (63%, 22/35), aer (94%, 33/35) and chuA genes (94%, 33/34) as well as a frequency of 46% (16/35) and 91% (32/34) for the pap GII and nanA genes, respectively. The bla CTX-M gene is predominant and a high frequency of exotoxins gives it a competitive advantage for spreading into the bloodstream.

Caracterización molecular de enterobacterias multirresistentes en dos departamentos de la selva peruana / Molecular characterization of multiresistant enterobacteria in two departments of the Peruvian jungle

Resumen | Introducción. La aparición de enterobacterias multirresistentes y productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) en pacientes de consulta externa con infecciones urinarias, representa un problema de salud pública en Perú. Objetivos. Caracterizar molecularmente enterobacterias multirresistentes aisladas de pacientes con diagnóstico de infección urinaria y procedentes de dos departamentos de la selva peruana. Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo, observacional y retrospectivo de 61 aislamientos de urocultivo procedentes de la selva peruana durante 2017 y 2018. Los perfiles de resistencia se identificaron utilizando el sistema automatizado MicroScan™ y para la detección de los genes blaTEM, blaCTX-M, blaSHV se empleó una reacción en cadena de la polimerasa (PCR) convencional. Resultados. Las enterobacterias positivas para BLEE más frecuentes por departamento fueron Escherichia coli en Madre de Dios (25 %, 10/40) y Ucayali (76,2 %, 16/21). En ambos departamentos, el gen blaCTX-Mfue el más frecuente (25/61; 41 %), seguido por blaTEM(15/61; 24,6 %) y blaSHV (10/61; 16,4 %). En el perfil de sensibilidad antimicrobiana, se detectó 72,6 % de resistencia contra ampicilina, 82,3 % contra cefalotina y 88,7 % contra nitrofurantoína. Conclusiones. El porcentaje de cepas de enterobacterias multirresistentes productoras de BLEE en ambos departamentos fue del 57,4 % y el gen bla CTX-M fue el más frecuente.

Abstract | Introduction. The emergence of multiresistant enterobacteria producing extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) in outpatients with urinary tract infections represents a public health problem in Perú. Objectives. To characterize multiresistant enterobacteria isolated from patients diagnosed with urinary tract infection in two Peruvian jungle departments using molecular techniques. Materials and methods. We conducted a descriptive, observational, and retrospective study of 61 urine culture isolates from two departments in the Peruvian jungle during 2017-2018. Resistance profiles were identified using the MicroScan™ automated system and a conventional polymerase chain reaction (PCR) was used for the detection of blaCTX-M, blaTEMand blaSHV genes. Results. The most common positive ESBL enterobacteria for each department were Escherichia coli in Madre de Dios (10/40; 25%) and Ucayali (16/21; 76.2%). Gene blaCTX-Mwas the most prevalent in both departments (25/61; 41%), followed by blaTEM (15/61; 24.6%), and blaSHV (10/61; 16.4%). As for the antimicrobial susceptibility profile, we detected resistance levels of 72.6% for ampicillin, 82.3% for cephalothin, and 88.7% for nitrofurantoin. Conclusions. BLEE-producing multi-resistant enterobacteria strains in both departments were 57.4% and blaCTX-M was the most common gene.

Caracterización clínica de infecciones de tracto urinario producidas por enterobacterias productoras de betalactamasas de espectro extendido / Clinical characterization of urinary tract infections caused by extended-spectrum betalactamase producing enterobacteria

Introducción: Las infecciones de tracto urinario se encuentran entre las infecciones de mayor prevalencia en la parte clínica. Son un problema de salud global y se pueden presentar con o sin síntomas. Los agentes bacterianos aislados en mayor frecuencia son Escherichia coli, Klebsiella spp y Proteus spp. Objetivo: Caracterizar las infecciones de tracto urinario producidas por enterobacterias productoras de betalactamasas de espectro extendido en pacientes hospitalizados, Lima 2016-2018. Métodos: Se realizó un estudio descriptivo en 2 instituciones prestadoras de salud, en Lima, Perú, durante el periodo 2016-2018, a partir de los aislamientos de patógenos blee asociados a infecciones de tracto urinario. Se tuvieron en cuenta variables sociodemográficas, enfermedades asociadas, agentes aislados, tratamiento y respuesta clínica. Resultados: Se obtuvo un registro de 117 pacientes, con edad promedio de 58,18 ± 11,8 años; 65,0 por ciento fueron mujeres y 89,74 por ciento provenían del área urbana de Lima. Las enfermedades asociadas más frecuentes fueron diabetes (39,3 por ciento) y enfermedad renal moderada o grave (12,8 por ciento), con índice de Charlson medio de 2,70 ± 1,21. Los agentes aislados más comunes fueron Escherichia coli (92,3 por ciento), Klebsiella spp (6,0 por ciento) y Proteus spp (1,7 por ciento). Los tratamientos empíricos usados fueron ampicilina/sulbactam (18,9 por ciento), ciprofloxacino (49,6 por ciento) y nitrofurantoína (16,7 por ciento). El 49,2 por ciento de los pacientes recibió tratamiento dirigido, 22,8 por ciento ertapenem y 13,9 por ciento piperacilina/tazobactam. Conclusiones: Las personas con diabetes y enfermedad renal son un grupo vulnerable a las infecciones de tracto urinario. El agente causal aislado en mayor frecuencia fue Escherichia coli blee+. Los tratamientos de inicio luego de la identificación clínica de la infección urinaria fueron ciprofloxacino y cefalosporinas. Una vez obtenidos los resultados microbiológicos se modificó el tratamiento antibiótico a carbapenémicos y penicilinas. La revaloración de los antibióticos usados en pacientes con enfermedades asociadas es importante para el éxito del tratamiento(AU)

Introduction: Urinary tract infections are among the most prevalent infections in clinical practice. They are a global health problem and may present with or without symptoms. The bacterial agents most commonly isolated are Escherichia coli, Klebsiella spp. and Proteus spp. Objective: Characterize urinary tract infections caused by extended-spectrum betalactamase producing enterobacteria in hospitalized patients from Lima in the period 2016-2018. Methods: A descriptive study was conducted at two health institutions from Lima, Peru, in the period 2016-2018, based on isolation of ESBL pathogens associated to urinary tract infections. Attention was paid to sociodemographic variables, associated conditions, agents isolated, treatment and clinical response. Results: A sample was selected of 117 patients; mean age was 58.18 ± 11.8 years; 65.0 percent were women and 89.74 percent came from the urban area of Lima. The most common associated conditions were diabetes (39.3 percent) and moderate or serious kidney disease (12.8 percent), with a mean Charlson index of 2.70 ± 1.21. The most common isolated agents were Escherichia coli (92.3 percent), Klebsiella spp. (6.0 percent and Proteus spp. (1.7 percent). The empirical treatments used were ampicillin/sulbactam (18.9 percent), ciprofloxacin (49.6 percent) and nitrofurantoin (16.7 percent). 49.2 percent of the patients received targeted treatment, 22.8 percent ertapenem and 13.9 percent piperacillin/tazobactam. Conclusions: People with diabetes and kidney disease are vulnerable to urinary tract infections. The causative agent most commonly isolated was ESBL Escherichia coli. The initial treatments indicated after clinical identification of urinary infection were ciprofloxacin and cephalosporins. When microbiological results were obtained, antibiotic therapy was changed to carbapenems and penicillins. Reassessment of the antibiotics used in patients with associated conditions is important for the success of the treatment(AU)

Caracterización microbiológica y molecular de la resistencia antimicrobiana de Escherichia coli uropatógenas de hospitales públicos peruanos / Microbiological and molecular characterization of antimicrobial resistance in uropathogenic Escherichia coli from peruvian public hospitals

RESUMEN Se caracterizó la resistencia antimicrobiana de 70 aislados de Escherichia coli obtenidos de pacientes con infección del tracto urinario (ITU) provenientes de ocho hospitales públicos en el Perú. Los perfiles de resistencia fueron identificados mediante el uso del sistema automatizado MicroScan®. Se utilizó una reacción en cadena de la polimerasa convencional para la detección de los genes bla TEM, bla CTX-M, bla SHV y bla PER. El 65,7% (46/70) de los aislados presentó un fenotipo multidrogorresistente y el 55,7% (39/70) fue identificado como productores de betalactamasas de espectro extendido. Se detectaron altos niveles de resistencia para ampicilina (77,1%), ciprofloxacina (74,3%), trimetoprim/sulfametoxazol (62,9%), cefepime (57,1%) y cefuroxima (57,1%). El gen bla TEM fue el más frecuente con un 31,4%, seguido por bla CTX-M (18,6%) y bla SHV (2,9%). Los resultados evidencian altos niveles de resistencia a antimicrobianos de importancia clínica en aislados de E. coli de pacientes con ITU en el Perú.

ABSTRACT We characterized the antimicrobial resistance of 70 Escherichia coli isolates obtained from patients with a urinary tract infection (UTI) from 8 public hospitals in Peru. Resistance profiles were identified using the automated MicroScan® system. A standard polymerase chain reaction was used for the detection of the bla TEM, bla CTX-M, bla SHV and bla PER genes. The 65.7% (46/70) of the isolates presented a multidrug-resistant phenotype and 55.7% (39/70) were extended-spectrum beta-lactamases producers. High levels of resistance were detected for ampicillin (77,1%), ciprofloxacin (74,3%), trimethoprim/sulfamethoxazole (62,9%), cefepime (57,1%), and cefuroxime (57,1%). The bla TEM gene was the most frequent (31,4%), followed by bla CTX-M (18,6%) and bla SHV (2,9%) genes. These results show high resistance levels to antimicrobials of clinical use in E. coli isolates from hospital UTI patients in Peru.

Caracterización microbiológica y molecular de la resistencia antimicrobiana de Escherichia coli uropatógenas de hospitales públicos peruanos / Microbiological and molecular characterization of antimicrobial resistance in uropathogenic Escherichia coli from peruvian public hospitals

RESUMEN Se caracterizó la resistencia antimicrobiana de 70 aislados de Escherichia coli obtenidos de pacientes con infección del tracto urinario (ITU) provenientes de ocho hospitales públicos en el Perú. Los perfiles de resistencia fueron identificados mediante el uso del sistema automatizado MicroScan®. Se utilizó una reacción en cadena de la polimerasa convencional para la detección de los genes bla TEM, bla CTX-M, bla SHV y bla PER. El 65,7% (46/70) de los aislados presentó un fenotipo multidrogorresistente y el 55,7% (39/70) fue identificado como productores de betalactamasas de espectro extendido. Se detectaron altos niveles de resistencia para ampicilina (77,1%), ciprofloxacina (74,3%), trimetoprim/sulfametoxazol (62,9%), cefepime (57,1%) y cefuroxima (57,1%). El gen bla TEM fue el más frecuente con un 31,4%, seguido por bla CTX-M (18,6%) y bla SHV (2,9%). Los resultados evidencian altos niveles de resistencia a antimicrobianos de importancia clínica en aislados de E. coli de pacientes con ITU en el Perú.

ABSTRACT We characterized the antimicrobial resistance of 70 Escherichia coli isolates obtained from patients with a urinary tract infection (UTI) from 8 public hospitals in Peru. Resistance profiles were identified using the automated MicroScan® system. A standard polymerase chain reaction was used for the detection of the bla TEM, bla CTX-M, bla SHV and bla PER genes. The 65.7% (46/70) of the isolates presented a multidrug-resistant phenotype and 55.7% (39/70) were extended-spectrum beta-lactamases producers. High levels of resistance were detected for ampicillin (77,1%), ciprofloxacin (74,3%), trimethoprim/sulfamethoxazole (62,9%), cefepime (57,1%), and cefuroxime (57,1%). The bla TEM gene was the most frequent (31,4%), followed by bla CTX-M (18,6%) and bla SHV (2,9%) genes. These results show high resistance levels to antimicrobials of clinical use in E. coli isolates from hospital UTI patients in Peru.

Utilidad de la citometría de flujo para la detección de Pseudomonas aeruginosa productoras de metalobetalactamasas / Utility of flow citometry for detecting metallo-beta-lactamase-producing Pseudomonas aeruginosa

RESUMEN Con el objetivo de determinar la utilidad de la citometría de flujo para la detección de Pseudomonas aeruginosa productoras de metalobetalactamasas (MBL), se estudiaron aislamientos de P. aeruginosa genotípicamente caracterizados del cepario del laboratorio de Epidemiología Molecular y Genética de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Se analizaron 29 aislamientos (17 productoras de MBL y 12 no productoras de MBL) con el kit de viabilidad celular FACSCalibur (Becton Dickinson). Se utilizaron dos tratamientos, uno con meropenem y el otro con meropenem-EDTA. Usando la razón de aumento de fluorescencia en las células no vivas, se demostró una diferencia significativa entre las productoras de MBL y las no MBL, considerando como punto de corte una razón >1,6. Se determinó una sensibilidad de 94,1% y una especificidad del 100%. La citometría de flujo constituye una alternativa para la detección de P. aeruginosa productora de MBL.

ABSTRACT In order to determine the utility of flow cytometry for detecting metallo-beta-lactamase (MBL)-producing Pseudomonas aeruginosa, we used genotypically characterized P. aeruginosa isolates from the Molecular Epidemiology and Genetics Laboratory of the Universidad Nacional Mayor de San Marcos. A total of 29 isolates (17 MBL-producing and 12 non-MBL-producing) were analyzed with the FACSCalibur (Becton Dickinson) cell viability kit. Two treatments were used, one with meropenem and the other with meropenem-EDTA. A significant difference between MBL and non-MBL-producing P. aeruginosa was demonstrated using the fluorescence ratio in non-living cells, considering a cut-off point of >1.6. We determined a sensitivity of 94.1% and a specificity of 100%. Flow cytometry represents an alternative for the detection of MBL-producing P. aeruginosa.

Detection of carbapenem hydrolyzing enzyme and extendedspectrum beta-lactamase in clinical isolates of Enterobacteriaceae and Pseudomonaceae / Detecção de enzimas hidrolizantes de carbapenemas e beta-lactamases de espectro estendido em isolados clínicos de Enterobacteriaceae e Pseudomonaceae

Objective: Characterize isolates of enterobacterias and pseudomonas based on their resistance to the antibiotics. Methods: This study was conducted with 44 samples from various species from the Enterobacteriaceae and Pseudomonaceae family and they were submitted to the Modified Hodge Test and Extended Spectrum Beta-Lactamase (ESBL) test. Results: From the 44 analyzed samples nine produced ESBL and ten produced some kind of carbapenemase. Conclusion: In total, 38,6% of the samples showed an increased in the incidence of this resistance in the last few years given that before 2001 there was not a single carbapenemase described. This fact alarms patients immunosuppressed or hospitalized since they colonize our digestive tract and can cause an infection given the opportunity.

Objetivo: Caracterizar isolados de enterobactérias e pseudomonas em relação a sua resistência aos antimicrobianos. Métodos: O estudo foi realizado com 44 amostras de várias espécies das famílias Enterobacteriaceae e Pseudomonaceae, as quais foram submetidas aos testes de Hodge Modificado e Beta-Lactamase de Espectro Estendido (ESBL). Resultados: Das 44 amostras analisadas nove são produtoras de ESBL e dez são produtoras de carbapenemase. Conclusão: No total, 38,6% das amostras apresentaram algum tipo de resistência às ESBL e carbapenemases, e esse número mostra um aumento na incidência dessas resistências nos últimos anos já que, antes de 2001, não haviam sido descritas as enzimas car­­­ba­­­penemases. Esse fato é alarmante para pacientes imunossuprimidos ou hospitalizados uma vez que as enterobactérias colonizam nosso trato digestivo e podem causar uma infecção se dada a oportunidade.

Características clínicas y microbiológicas de infecciones por Klebsiella pneumoniae productora de carbapenemasa MBL, tipo NDM, Hospital Geriátrico San Isidro Labrador EsSalud, 2018 / Clinical and microbiological characteristics of New Delhi MBL (NDM)-producing Klebsiella pneumoniae infections at the Hospital Geriátrico San Isidro Labrador EsSalud, 2018

RESUMEN Objetivo Determinar las características clínico-microbiológicas de 7 casos de infección nosocomial por Klebsiella pneumoniae productora de carbapenemasa MBL, tipo NDM, en el Hospital Geriátrico San Isidro Labrador (HG SIL) en el periodo de febrero a mayo de 2018. Materiales y métodos Es un estudio descriptivo y retrospectivo realizado en adultos mayores con infecciones urinarias, neumonías, úlceras sacras e infecciones de herida operatoria que recibieron terapia antibiótica múltiple no protocolizada. El método usado para detectar la MBL fue el de doble disco con ácido fenilborónico (APB) y ácido etilendiaminotetraacético (EDTA) en los aislados de Klebsiella pneumoniae con sensibilidad disminuida a carbapenémicos. La identificación del gen NDM se realizó en el Instituto Nacional de Salud mediante reacción en cadena de la polimerasa. Resultados En total, fueron 7 casos positivos para el gen NDM y todos resistentes al meropenem lo que confirmó el brote epidémico. La mortalidad fue 28,6 % (2 de 7 pacientes) pero, debido a la existencia de comorbilidades en todos los casos, no se pudo determinar la mortalidad atribuible. Conclusiones Destacan el rol clave inicial del laboratorio para detectar y tipificar las carbapenemasas y las medidas de control integral de las infecciones. Además, son los primeros casos reportados en nuestra red asistencial.

ABSTRACT Objective To determine the clinical and microbiological characteristics of seven (7) cases of New Delhi MBL (NDM)- producing Klebsiella pneumoniae nosocomial infections at the Hospital Geriátrico San Isidro Labrador (HG SIL) from February to May 2018. Materials and methods A descriptive and retrospective study conducted in elderly people with urinary infections, pneumonia, sacral ulcers and surgical wound infection who received multiple non-protocolized antibiotic therapy. The methods used to detect MBLs in the Klebsiella pneumoniae isolates that showed decreased sensitivity to carbapenems were the phenylboronic acid-based (PBA) and ethylenediaminetetraacetic acid-based (EDTA) double disk tests. The identification of the NDM gene was performed by polymerase chain reaction at the Instituto Nacional de Salud. Results In total, the seven cases were positive for the NDM gene and resistant to meropenem, which confirmed the epidemic outbreak. Mortality accounted for 28.6 % (2 of 7 patients) of the cases. However, due to the presence of comorbidities in all cases, the attributable mortality could not be determined. Conclusions Labs have a key initial role for detecting and classifying the carbapenemases and the measures of comprehensive control of infections. The aforementioned cases are the first ones reported in our healthcare network.

Estudio Observacional: Uso de Antimicrobianos en la Unidad de Cuidados Intensivos del Hospital SOLCA Guayaquil-Ecuador Publicaciones del Proyecto de Optimización de Uso de Antibióticos en Latinoamérica (PROA) / Observational Study: Use of Antimicrobials in the Intensive Care Unit of the SOLCA-Guayaquil Hospital

Introducción: Los programas de optimización del uso de antimicrobianos (PROA) surgen ante la necesidad de disminuir el porcentaje de infecciones por microorganismos resistentes a los antimicrobianos, lo cual beneficiaria con mejores resultados clínicos, disminuyendo efectos adversos y reduciendo el gasto que involucra el uso de los mismos. Este programa se implementó en la unidad de cuidados intensivos del hospital oncológico SOLCA Guayaquil, durante un año. Es objetivo del presente estudiofueestablecer la tasa de uso de antimicrobianos en una Unidad de Cuidados Intensivos(UCI) el porcentaje de descalamiento y la epidemiología de las infecciones en UCI. Métodos: En este estudio observacional prospectivo, con muestra no probabilística se incluyeron todos los casos ingresados en la UCIdel Instituto Oncológico Nacional Dr. Juan Tanca Marengo de la ciudad de Guayaquil, en el período julio 2018 a junio 2019. Las variablesfueron prevalencia del uso de antibióticos, tipo de antibiótico usado, descalamiento de antibioterapia, adherencia del personal a las guías clínicas y dosis diarias definidas (DDD) y el índice días-paciente mes por área de internación. Resultados: Se incluyeron 246 pacientes; el 81% se encontraba recibiendo antibióticos, con un máximo de dos antibióticos por paciente; la profilaxis quirúrgica se mantuvo dentro de las primeras 24 horas en el 50% de la veces y el 25.66% la recibió por un periodo mayor a 24 horas; 57.25% tuvo un decalamiento mantenido, en el 20.75% de tipo escalado y el13.66% de tipo descalado. Entre los patógenos aislados están las enterobacterias productoras de beta lactamasas de espectro extendido positivas (BLEE+) con un 57% y las enterobacterias resistentes a los carbapenémicos con un 32%. El mayor consumo fue de carbapenémicos con 625.24g. seguidos de los inhibidores de betalactamasas con 402.94 g. La tasa de tratamientos empíricos del 49.58% vs el 26.41% de tratamientos dirigidos; y mortalidad bruta del 22.76%. Conclusión:La tasa de uso de antibióticos en UCI es alta, el porcentaje de descalamiento fue aceptable comparada con las tasas reportadas regionalmente, la epidemiología de gérmenes reportados más frecuentes son las enterobacterias productoras de beta lactamasa espectro extendido.

Introduction: Antimicrobial use optimization programs (PROA) arise due to the need to decrease the percentage of infections by antimicrobial resistant microorganisms, which would benefit from better clinical results, reducing adverse effects and reducing the expense involved in the use of the same. This program was implemented in the intensive care unit of the SOLCA Guayaquil cancer hospital for one year. The objective of the present study was to establish the rate of use of antimicrobials in an Intensive Care Unit (ICU), the percentage of descaling and the epidemiology of infections in the ICU. Methods:In this prospective observational study, with a non-probability sample, all the cases admitted to the ICU of the Dr. Juan Tanca Marengo National Oncological Institute in the city of Guayaquil, in the period July 2018 to June 2019 were included. The variables were prevalence of the antibiotic use, type of antibiotic used, antibiotics displacement, staff adherence to clinical guidelines and defined daily doses (DDD) and the patient-day-month index by hospitalization area. Results:246 patients were included; 81% were receiving antibiotics, with a maximum of two antibiotics per patient; Surgical prophylaxis was maintained within the first 24 hours 50% of the time and 25.66% received it for a period greater than 24 hours; 57.25% had a sustained offset, in 20.75% the scaled type and 13.66% the bare type. Isolated pathogens include 57% positive extended spectrum beta lactamase-producing enterobacteriaceae (ESBL +) and 32% carbapenem-resistant enterobacteriaceae. The highest consumption was of carbapenems with 625.24 g. followed by beta-lactamase inhibitors with 402.94 g. The empirical treatment rate of 49.58% vs. 26.41% of targeted treatments; and gross mortality of 22.76%. Conclusion:The rate of use of antibiotics in the ICU is high, the percentage of descaling was acceptable compared to the rates reported regionally, the epidemiology of the most frequent reported germs are the extended spectrum beta lactamase-producing enterobacteriaceae.

Caracterización de metalo-β-lactamasas en aislados clínicos de Pseudomonas aeruginosa recuperados de pacientes hospitalizados en el Hospital Militar Central / Characterization of metallo-β-lactamase in clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa retrieved from patients hospitalized in the Central Military Hospital

Con el objetivo de caracterizar y determinar la frecuencia de genes que codifican metalo-β-lactamasas (MBL) en aislados clínicos de Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa), se realizó un estudio transversal en el Hospital Militar Central (HMC) de Lima, Perú, entre enero y setiembre del 2016. Se analizaron 76 aislados de P. aeruginosa con sensibilidad disminuida a carbapenémicos y resistentes a ceftazidima. La detección fenotípica de MBL se realizó por el método de sinergia de doble disco entre imipenem y meropenem frente al ácido etilendiaminotetraacético (EDTA), y la identificación de los genes por reacción en cadena de la polimerasa. De los 76 aislados, 24 (31,6 %) fueron positivos para MBL por el método fenotípico, confirmándose genéticamente todos. Se encontró el gen blaIMP en 23/24 (95,8 %) y blaVIM en 1/24 (4,2 %). Ningún aislado presentó blaNDM. El gen blaIMP resultó ser el más frecuente entre los aislados clínicos de P. aeruginosa no sensibles a carbapenémicos en el HMC.

hat codify metallo-β-lactamases (MBL) in clinical isolates of Pseudomona aeruginosa (P. aeruginosa), a cross-sectional study was conducted in the Central Military Hospital (HMC) of Lima, Peru, between January and September, 2016. Seventy-six (76) isolates of P. aeruginosa with diminished sensitivity to carbapenemes and resistant to ceftazidime were analyzed. The phenotype detection of MBL was made by double disc synergy between imipenem and meropenem versus ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA), and the identification of the genes was performed by polymerase chain reaction. Of the 76 isolates, 24 (31.6%) were positive for MBL by the phenotype method, genetically confirming all. The blaIMP gene was found in 23/24 (95.8%) and blaVIM in 1/24 (4.2%). No isolate had blaNDM. The blaIMP gene turned out to be the most frequent among clinical isolates of P. aeruginosa not sensitive to carbapenemics at this Hospital.

Identificación de genes de resistencia a carbapenémicos en enterobacterias de hospitales de Perú, 2013-2017 / Identification of carbapenem-resistant genes in enterobacteria from peruvian hospitals, 2013-2017

RESUMEN La diseminación global de carbapenemasas es de importancia en la salud pública. El objetivo del estudio es describir la presencia de genes de resistencia a carbapenémicos tipo KPC y metalobetalactamasas en enterobacterias aisladas de 12 hospitales y remitidos al Laboratorio de Referencia Nacional de Infecciones Intrahospitalarias del Instituto Nacional de Salud de Perú durante los años 2013 al 2017. Las cepas fueron identificadas por métodos convencionales, la resistencia antimicrobiana fue determinada por métodos fenotípicos, bioquímicos y la presencia de genes de resistencia, se detectaron por PCR convencional. Se identificaron 83 cepas con carbapenemasas: 26 (31,3 %) portando el gen blaKPC, 56 (67,5 %) el gen blaNDM y una (1,2 %) cepa con el gen blaIMP. Es el primer reporte que da a conocer los genes de carbapenemasas circulantes en hospitales de Perú, por lo que se requiere mejorar la vigilancia para tener un mejor conocimiento de la situación en Perú.

ABSTRACT The global spread of carbapenemases is a significant public health concern. The aim of this report is to describe the presence of KPC-type carbapenem-resistant genes and enterobacteria isolated in 12 hospitals and forwarded to the Peruvian National Institute of Health's National Infection Reference Laboratory during the period between 2013 and 2017. The strains were identified by conventional methods; antimicrobial resistance was determined by phenotypic and biochemical methods. The presence of resistant genes was detected by conventional PCR. Eighty-three (83) strains harboring carbapenemases were identified: 26 (31.3%) carrying the blaKPC gene, 56 (67.5%) the blaNDM gene, and one strain (1.2%) with the blaIMP gene. This is the first report that shows the circulating carbapenemases genes in Hospitals in Peru of cases submitted for their confirmation to the National Reference Laboratory, so it is necessary to improve the surveillance to better understand their situation in our country.

New Delhi metalobetalactamase (NDM): uma revisão / Metallobetalactamase New Delhi: a review

O surgimento da enzima metalobetalactamase "New Delhi" (NDM-1) incrementou a possibilidade das bactérias se tornarem multirresistentes. Esta betalactamase foi relatada pela primeira vez em 2009, em isolados clínicos de Klebsiella pneumoniae e Escherichia coli oriundos de um paciente sueco hospitalizado na Índia. Tendo em vista a ampla resistência desenvolvida por bactérias portadoras do gene blaNDM e seu elevado índice de disseminação, o presente artigo buscou apresentar e discutir aspectos importantes sobre essa metaenzima, como mecanismo de ação, detecção laboratorial, controle de infecção e possibilidades de tratamento.

The emergence of metalobetalactamase enzyme "New Delhi" (NDM-1) increased the chance of bacteria becoming multiresistant. This betalactamase was first reported in 2009 in clinical isolates of Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli derived from a Swedish patient hospitalized in India. Given the widespread resistance developed by bacteria carrying the gene blaNDM and its high rate of spread, this paper aims to present and discuss important aspects of this metalobetalactamase as mechanism of action, laboratorial detection, infection control and treatment possibilities

Escherichia coli resistente a la fosfomicina: un hecho que nos invita a reflexionar sobre la resistencia bacteriana / Escherichia coli resistant to fosfomycin: a fact that invite us to think about antibiotic resistance

La resistencia bacteriana es un problema de salud pública que dificulta cada vez más el tratamiento de los pacientes con infecciones del tracto urinario o de otros sistemas. Si bien los casos de resistencia estaban restringidos al entorno hospitalario, en la actualidad son más comunes las infecciones adquiridas en la comunidad causadas por bacterias ultirresistentes. En este artículo se presenta una reflexión acerca del riesgo que representa la multirresistencia, y el surgimiento de resistencia a las alternativas terapéuticas para el tratamiento exitoso de las infecciones de tracto urinario, así como se reflexiona sobre puntos clave relacionados con el uso adecuado de las pruebas diagnósticas y los antibióticos en este tipo de infecciones.

Antibiotic resistance is a public health problem that makes urinary tract infections and infections in other organs increasingly difficult to treat. Although bacterial resistance was once restricted to hospitals, nowadays community acquired infections caused by multidrug resistant bacteria are be comingincreasingly more common. This review article reflects on the risks associated with antibiotic resistance and the emergence of resistance to alternative antibiotic treatments available for the successful treatment of urinary tract infections; it also considers key points concerning the proper use of diagnostic tests and the antibiotic drugs used to diagnose and treat these infections.

Detección de genes shv y tem en cepas de Escherichia coli productoras de B-lactamasas de espectro extendido procedentes de dos centros hospitalarios de Chiclayo- Perú: enero- agosto 2011

Describir la frecuencia de distribucion de los genes blaTEM y blaSHV en cepas de Escherichia coli productoras de �À- lactamasas de espectro extendido (BLEE) procedentes de dos centros hospitalarios de Chiclayo. Material y Metodos: Estudio de tipo descriptivo, trasversal. Las cepas de Escherichia coli productoras de BLEE fueron seleccionadas de pacientes con infeccion urinaria internados en los servicios de Cuidados Intensivos, Ginecologia, Medicina Interna y Cirugia de los hospitales Almanzor Aguinaga Asenjo y Las Mercedes. Las cepas fueron confirmadas previamente en los laboratorios de los dos hospitales usando las prueba fenotipica de Jarlier (Hospital Las Mercedes) y el sistema automatizado Vitek 2 (Hospital Nacional Almanzor Aguinaga Asenjo); el analisis de deteccion de los genes blaTEM y blaSHV se hizo por PCR en el Laboratorio de Genetica de la Universidad Catolica Santo Toribio de Mogrovejo. Resultados: Un total de 66 cepas de Escherichia coli recolectadas desde Enero a Agosto del 2011 fueron confirmadas como BLEE; de estas se confirmo que 40 cepas (60,61%) presentaron el gen blaTEM, 8 cepas (12,12%) presentaron el gen blaSHV y 18 cepas (27,27%) no presentaron ninguno de los dos. Ninguna de las cepas presento ambos genes. Conclusión: los genes blaTEM y blaSHV fueron frecuentes en las cepas BLEE de ambos hospitales, siendo más frecuente el gen blaTEM.(AU)

Objective: To describe the distribution frequency of blaTEM and blaSHV genes in extended spectrum À-lactamase producing Escherichia coli strains of two hospitals of Chiclayo.Material and Methods: Transversal, descriptive study.Extended spectrum À- lactamase (ESBL) Escherichia coli strains were initially obtained from urine cultures of patients with urinary tract infection from the services of Internal Medicine, Surgery, Intensive care unit and Urology from two hospitals of Chiclayo. The strains were previously confirmed in the laboratories using Jarlier's phenotypic method (Hospital las Mercedes) and the Vitek 2 automated system (Hospital Nacional Almanzor Aguinaga Asenjo); the genetic detection analysis of blaTEM and blaSHV genes was done by PCR (Polymerase chain reaction) in the Genetics Laboratory of Universidad Catolica Santo Toribio de Mogrovejo. Results: A total of 66 strains of Escherichia coli isolated since January to August 2011 were classified as ESBL; by PCR, the blaTEM gen was found in 40 strains (60.61%), the blaSHV gen in 8 strains (12.12%), and both genes were absent in 18 strains (27.27%).Conclusion: blaTEM and blaSHV genes were frequently detected in ESBL strains from both hospitals; being the blaTEM the most frequent.(AU)

Frecuencia de enzimas asociadas a sensibilidad disminuida a betalactámicos en aislados de enterobacterias, Caracas, Venezuela / Frequency of enzymes associated with reduced sensitivity to beta-lactamantibiotics in enterobacteria isolates, Caracas, Venezuela

Objective. To determine the frequency of enzymatic mechanisms associated with reduced sensitivity to broad-spectrum beta-lactam antibiotics in enterobacteria isolates obtained at hospital centers in Caracas, Venezuela.Methods. A cross-sectional study was conducted on enterobacteria isolated from patients at eight hospital centers in Caracas, Venezuela, from 15 October 2009 to 15 January 2010. The species were identified using conventional biochemical tests, and their susceptibility to antimicrobial drugs was assessed by antibiogram (Kirby-Bauer method), using the 2010 performance standards published by the Clinical and Laboratory Standards Institute. Beta-lactam-resistant genes were detected using an enhanced polymerase chain reaction assay.Results. Of 1 235 isolates, 207 (16.8%) exhibited resistance to third- and fourthgeneration cephalosporins, carbapenems, or both. They presented the following phenotypes: extended-spectrum beta-lactamase (ESBL), 93.8%; depressed AmpC, 4.3%; and carbapenemase, 1.9%. Further characterization of the first two phenotypes yielded the following breakdown of types: SHV, 36.7%; CTX-M-1 group, 22.3%; TEM, 21.7%; CTX-M-1 group with impermeability, 5.2%; two-enzyme combinations, 4.5%;CTX-M-2 group, 4.3%; PER, 3.4%; and KPC, 1.9%. The SHV type was predominant in the public hospital strains, whereas the CTX-M-1 group was most common in the strains from the private hospitals. Conclusions. Of the enzymatic mechanisms investigated, the SHV type was the most frequent, followed by the CTX-M-1 group and the TEM type. Also, a high percentageof type KPC was found. The research reported here is one of only a few multicenter studies that have been conducted in Venezuela to evaluate the frequency of this type of antimicrobial resistance mechanism, including phenotypical and molecular characterization...

Objetivo. Determinar la frecuencia de los mecanismos enzimáticos asociados a sensibilidad disminuida a los antibióticos betalactámicos de amplio espectro en aislados de enterobacteriasobtenidos de centros hospitalarios de Caracas, Venezuela. Métodos. Se realizó un estudio transversal con enterobacterias aisladas de pacientes de ocho centros hospitalarios de Caracas, Venezuela, desde el 15 de octubre de 2009 al 15 de enero de2010. La identificación se realizó mediante pruebas bioquímicas convencionales, y la susceptibilidada los antimicrobianos mediante antibiograma (Kirby-Bauer), según las normas de 2010 del Instituto de Estándares Clínicos y de Laboratorio. La detección de los genes de resistenciaa betalactámicos se realizó mediante amplificación por reacción en cadena de polimerasa. Resultados. De 1 235 aislados, 207 (16,8%) mostraron resistencia a cefalosporinas de terceray cuarta generación o a carbapenemes o a ambos. De esos, 93,8% presentaron fenotipo betalactamasa de espectro extendido (BLEE); 4,3%, fenotipo AmpC derreprimido, y 1,9%, fenotipocarbapenemasa. La caracterización de los dos primeros fenotipos determinó que 36,7% eran tipo SHV; 22,3%, grupo CTX-M-1; 21,7%, tipo TEM; 5,2%, grupo CTX-M-1 + impermeabilidad; 4,5%, combinación de dos enzimas; 4,3%, grupo CTX-M-2; 3,4%, tipo PER, y 1,9%, tipo KPC.Se observó un predominio del tipo SHV en las cepas obtenidas de hospitales públicos y del grupo CTX-M-1, en los privados. Conclusiones. De los mecanismos enzimáticos investigados, el tipo SHV fue el más frecuente,seguido del grupo CTX-M-1 y tipo TEM. Asimismo, se encontró un alto porcentaje de carbapenemasas tipo KPC. Este es uno de los pocos estudios multicéntricos realizados enVenezuela donde se evalúa la frecuencia de este tipo de mecanismo de resistencia a los antimicrobianos,incluida la caracterización fenotípica y molecular...

Impacto de una política de restricción de uso de antibióticos en la unidad neonatal del Hospital Militar Central / Impacto de uma politica de restrição de uso de antibióticos na unidade neonatal do Hospital Militar Central de Bogota / The impact of an antibiotic restriction policy in the intensive care unit at the Hospital Militar Central

Teniendo en cuenta que el uso indiscriminado de antibióticos de amplio espectro ha favorecido la aparición de resistencia bacteriana a múltiples drogas, se realizó un estudio de intervención cuasiexperimental entre enero de 2002 y enero de 2006 en la unidad de cuidados intensivos neonatal (UCIN) del Hospital Militar Central de Bogotá (HMC), en el que se restringió el uso de cefalosporinas de 3ª generación cambiándolas por antibióticos no asociados con inducción de beta-lactamasas de espectro extendido (BLEEs), utilizando piperazilina-tazobactam y cefepime. En el estudio se hizo comparación antes y después de la política de restricción antibiótica en infecciones nosocomiales por gérmenes gram negativos, encontrándose que de 2880 pacientes que ingresaron a UCIN, el 24,5% tuvo diagnóstico de infección y de ellos, el 30,7% correspondió a infecciones hospitalarias. De los gérmenes aislados el 49% correspondió a bacterias gram negativas, con una producción de BLEEs en el 51% de los aislados de Klebsiella pneumoniae, de 28% en los de Escherichia coli, de 14% en los de Acinetobacter baumannii y de 7% en los de Serratia. En el 70% de los casos con presencia de BLEEs se habían utilizado cefalosporinas de III generación. Luego de la restricción de cefalosporinas de III generación se observó una importante disminución en los aislamientos de los gérmenes productores de resistencia betalactámica (del 20% en el primer periodo, se bajó a menos del 4% en el segundo), es decir que el riesgo producir BLEEs disminuyó casi cinco veces, con una razón de prevalencia de 4,91(IC 95%: 1,14-21,09) y un valor de p=0,031 respecto al periodo anterior, pudiéndose concluir que la adopción de una política de restricción en el uso de antibióticos tuvo un significativo efecto reductor en la incidencia de BLEEs en la UCIN de nuestro hospital, disminuyendo a su vez los costos, pues se redujo el uso de carbapenems...

Considering that the indiscriminate use of wide spectrum antibiotics has favour the appearance of bacterial resistance to multiple drugs, a quasi-experiemental intervention study was performed between January 2002 and January 2006, in the neonatal intensive care unit (NICU) of the Hospital Militar Central in Bogotá (HMC), in which the use of cephalosporins of 3th generation was restricted and changed for antibiotics non associated with the induction of beta-lactamases of extended spectrum (ESBLs), by the use of piperacillin-tazobactam and cefepime. A comparison was done before and after the restriction policy was applied in nosocomial infections produced by gram-negative bacteria. It was found that 24, 5% out of 2880 patients were diagnose with infections and among them, 30,7% were nosocomial infection. 49% of isolated germs were Gram-negative bacteria from which 51% of Klebsiella pneumoniae, 28% of Escherichia coli, 14% of Acinetobacter baumannii and 7% of Serratia isolates produced ESBLs. In 70% of the ESBLs cases, cephalosporins of 3er generation were used. After restriction of cephalosporins of 3 th generation an important decreased in the number of beta-lactamic resistance isolates were observed (from 20% during the first period to less than 4 % during the second), which means that the risk of ESBLs production decreased five times, with a ratio of prevalence of 4,91 (IC 95%: 1,14-21,09) and a p value of 0,031 with respect to the previous period. It can be conclude that the adoption of a restriction policy in the use of antibiotics had a significant reductor effect on the incidence of ESBLs in NICU of our Hospital, which implies a reduction of costs as the use of carbapenems was also reduced...

Tendo em conta que o uso indiscriminado de antibióticos de amplo espectro favoreceu a aparição de resistência bacteriana a numerosos medicamentos, realizou-se um estudo de intervenção experimental entre janeiro de 2002 e janeiro de 2006 na unidade de terapia intensivos neonatal (UTIN) do Hospital Militar Central de Bogotá, no que se restringiu o uso de cefalosporinas de III geração mudando-as por antibióticos não associados com indução de beta-lactamasas de espectro estendido (BLEEs), utilizando piperazilina-tazobactam e cefepime. No estudo se fez comparação antes e depois da política de restrição antibiótica em infecções nosocomiais por bactérias gram negativos, encontrando-se que de 2880 pacientes que ingressaram a UTIN, o 24,5% teve diagnóstico de infecção e deles, o 30,7% correspondeu a infecções hospitalares. Dos germens isolados o 49% correspondeu a bactérias gram negativas, com uma produção de BLEEs no 51% dos isolados de Klebsiella, de 28% nos de Escherichia coli, de 14% nos de Acinetobacter e de 7% nos de Serratia. No 70% dos casos com presença de BLEEs se tinham utilizado cefalosporinas de III geração. Depois da restrição de cefalosporinas de III geração se observou uma importante diminuição nos isolamentos dos germes produtores de resistência beta-lactámica (do 20% no primeiro período, baixou-se a menos do 4% no segundo), isto é que o risco produzir BLEEs diminuiu quase cinco vezes, com uma razão de prevalência de 4,91(IC 95%: 1,14-21,09) e um valor de p=0,031 com respeito ao período anterior, podendo-se concluir que a adoção de uma política de restrição no uso de antibióticos teve um significativo efeito redutor na incidência de BLEEs na UTIN de nosso hospital, diminuindo a sua vez os custos, pois se reduziu o uso de carbapenems...